Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Wdr53Q9DB94 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Wdr53Q9DB94 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms