Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smg9Q9DB90 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms