Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms