Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700012A03RikQ9DAF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms