Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samd8Q9DA37 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms