Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdzd9Q9D9M4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms