Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Actrt1Q9D9J3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms