Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9D9H8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q9D9H8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms