Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmco5aQ9D9D5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmco5aQ9D9D5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmco5aQ9D9D5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms