Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ifrd2Q9D8U0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ifrd2Q9D8U0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms