Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin37Q9D8N6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lin37Q9D8N6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms