Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc91Q9D8L5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc91Q9D8L5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms