Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc52a2Q9D8F3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms