Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alkbh4Q9D8F1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alkbh4Q9D8F1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alkbh4Q9D8F1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Alkbh4Q9D8F1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Alkbh4Q9D8F1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Alkbh4Q9D8F1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Alkbh4Q9D8F1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms