Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms