Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fip1l1Q9D824 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fip1l1Q9D824 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms