Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rep15Q9D7T1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rep15Q9D7T1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rep15Q9D7T1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rep15Q9D7T1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rep15Q9D7T1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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