Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem54Q9D7S1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms