Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnfsf13Q9D777 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tnfsf13Q9D777 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms