Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce1Q9D720 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce1Q9D720 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms