Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rtl8cQ9D6I0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtl8cQ9D6I0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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