Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Rab11fip1Q9D620 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip1Q9D620 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Rab11fip1Q9D620 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip1Q9D620 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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