Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc39Q9D5Y1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Ccdc39Q9D5Y1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc39Q9D5Y1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc39Q9D5Y1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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