Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efhd1Q9D4J1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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Efhd1Q9D4J1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Efhd1Q9D4J1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms