Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D454 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9D454 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D454 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9D454 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9D454 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9D454 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9D454 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D454 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms