Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
4933428M09RikQ9D3X3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms