Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l4Q9D2A5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l4Q9D2A5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms