Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nol3Q9D1X0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nol3Q9D1X0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms