Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9D1F3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9D1F3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms