Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms