Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nde1Q9CZA6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nde1Q9CZA6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms