Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
3110001I22RikQ9CZ70 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
3110001I22RikQ9CZ70 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms