Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsfl1cQ9CZ44 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsfl1cQ9CZ44 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms