Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ChtopQ9CY57 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ChtopQ9CY57 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms