Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mis12Q9CY25 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms