Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Sgo1Q9CXH7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sgo1Q9CXH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sgo1Q9CXH7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sgo1Q9CXH7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgo1Q9CXH7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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