Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prdm5Q9CXE0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Prdm5Q9CXE0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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