Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmd8Q9CX56 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms