Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd4Q9CWX4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd4Q9CWX4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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