Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxxc1Q9CWW7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms