Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tdrd12Q9CWU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd12Q9CWU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms