Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot11Q9CWN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot11Q9CWN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot11Q9CWN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot11Q9CWN7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot11Q9CWN7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot11Q9CWN7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms