Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdca4Q9CWM2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdca4Q9CWM2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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