Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms