Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930553M12RikQ9CUH1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms