Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nkiras2Q9CR56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nkiras2Q9CR56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms