Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4931417E11RikQ9CR05 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms