Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tma16Q9CR02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tma16Q9CR02 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tma16Q9CR02 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tma16Q9CR02 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms