Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atg12Q9CQY1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms