Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifitm3Q9CQW9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Ifitm3Q9CQW9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ifitm3Q9CQW9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ifitm3Q9CQW9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ifitm3Q9CQW9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifitm3Q9CQW9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms